Arafi mudou-se ainda criança para Qom, principal centro teológico do país, onde estudou com figuras que mais tarde ocupariam postos-chave no regime. Ao longo dos anos, alcançou o título de mujtahid, que lhe confere autoridade para interpretar a lei islâmica. Ele é fluente em árabe e inglês, e já disse estar disposto a conversar com os países que estão atacando para cessarem os bombardeios à República Islâmica.