O Centro de Controle de Zoonoses (CCZ) atende e acolhe animais abandonados que apresentam alguma enfermidade, o controle de doenças transmissíveis a seres humanos como raiva, febre maculosa, esporotricose e leishmaniose, desempenha atividades relacionadas ao combate à dengue, zika e chikungunya, além de desenvolver campanhas como a antirrábica animal, que acontece anualmente. Outro papel importante desenvolvido pelo CCZ é o procedimento de castração e o projeto de Feiras de Adoção de cães e gatos.
